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大纲
第三章
第一、祂「从天上来的，是在万有之上（31节）。祂必须和其它属乎地的分别开来。我们不能以地上的标准来衡量祂。因此，祂与施洗约翰是截然不同的。
第二、祂的见证建基于个人的经验（32节）。
第三、虽然有些人拒绝了祂的见证，但接受的人却能因此而「证明神是真的。」（33节）。
第四、神会赐圣灵给祂所差来的人（34节）。旧约的先知是按着他们的使命得圣灵不同程度的能力，耶稣得圣灵却是没有限制的，更加突显了耶稣作为神的儿子的身分。
第五、耶稣使命的印记，就是天父爱祂及把万有交托给祂（35节）。从天父给予祂的托付就可见一斑了（参五22，十二49，十七2、24）。
第36节约翰总结了整章的教训，人面对的考验就是是否相信，这和拒绝耶稣成了强烈的对比。神的「震怒」是神圣洁属性的彰显，而非一种非人格化的机械性反应。人只有借着信心方能逃避神的震怒。「得见永生」（参和合本小字）就是亲身经历了生命；神震怒的结果就是人无法经历真实的生命。
四章1至3联系了前后两段的记载。有关施洗约翰的讨论，带来法利赛人对耶稣及约翰二人洗礼的回应。他们能够容让约翰施洗，但是当受耶稣施洗的人数逐渐增加的时候，他们就不由得提高了警惕。耶稣把事奉的工场从犹太地转移到加利利。第2节括号内的插句是为了澄清法利赛人所听见关于耶稣施洗的事情，其实耶稣本没有亲自施洗。